แนวทางใหม่ที่เร็วทันใจและก็มีประสิทธิภาพสำหรับเพื่อการสร้างโปรไฟล์ของเซลล์ลำพัง

หลายเซลล์ภายในร่างกายของเราดำเนินการในลักษณะปิดบังวิทยาศาสตร์ที่ยังไม่เข้าใจ ที่ยังไปสำหรับเซลล์ภูมิคุ้มกันที่มีความหมายในการคุ้มครองป้องกันพวกเราจากโรคร้ายแรง

เพื่อที่จะเอาชนะอุปสรรคนี้นักวิจัยอุตสาหะเป็นอย่างมากสำหรับการหาวิธีใหม่ในการศึกษาเรียนรู้ผลงานข้างในของเซลล์แต่ละเซลล์

ความท้าทายคือไม่เพียงแค่ แม้กระนั้นจะแยกเซลล์ออกจากตัวอย่างเนื้อเยื่อนอกนั้นเรายังจำเป็นที่จะต้องหาวิธีการตรวจทานรูปแบบการทำงานของเซลล์แต่ละเซลล์ด้วย” ดร. เคดาร์ทุ่งนาธานนาน้ำผู้ช่วยศาสตราจารย์และก็หัวหน้างานวิจัยภาควิชาชีวเคมีแล้วก็ชีววิทยาระดับโมเลกุลกล่าว มหาวิทยาลัยเซาเทิร์นเดนมาร์ก

ในการค้นคว้าใหม่นำโดย Kedar Nath Natarajan รวมทั้ง Xi Chen จากสถาบัน Wellcome Sanger Institute ทีมงานนักวิจัยได้ปรับปรุงกรรมวิธีใหม่สำหรับเพื่อการทำเป็นชิ้นเล็กชิ้นเล็กภายในอวัยวะแล้วก็เนื้อเยื่อของกล้องจุลทรรศน์

ขั้นตอนการใหม่ช่วยให้พวกเขาสามารถพินิจพิจารณาเซลล์ได้มากกว่า 3000 เซลล์จากม้ามซึ่งเป็นจุดที่มีฮอตปอสำหรับเซลล์ภูมิคุ้มกันทุกจำพวก เซลล์ที่ต่อสู้กับการรับเชื้อ แต่ว่ายังทำให้ภูมิต้านทานในชีวิตประจำวันรวมทั้งการตอบสนอง

กระบวนการใหม่ๆได้รับการพัฒนาอย่างสม่ำเสมอเพื่อแสดงเนื้อหาของเซลล์เดี่ยวด้านในอวัยวะและเนื้อเยื่อ หลักการเป็นการเรียนรู้ต้นแบบเบื้องต้นของสิ่งมีชีวิตดังเช่นว่า DNA แล้วก็กรรมวิธีการใส่ข้างในเซลล์เดียว บรรจุภัณฑ์นี้เรียกว่า chromatin และก็สัญญาณที่ยีนข้างในพิมพ์เขียวถูกเปิดรวมทั้งปิดโดยเหตุนั้นก็เลยพินิจพิเคราะห์ว่าจะแปลงเป็นเซลล์เม็ดเลือดเซลล์ผิวหนังเซลล์ภูมิต้านทานเซลล์มะเร็งหรือเซลล์ชนิดอื่น

ขั้นตอนการใหม่ของเราในการทำให้โครเมียมภายในเซลล์เดียวมีทางเลือกที่มีคุณภาพสามารถปรับขนาดได้และถูกกว่าสำหรับวิธีการที่ทันสมัยที่สุดซึ่งจะต้องมีส่วนประกอบเบื้องต้นที่มีราคาแพงอุปกรณ์พิเศษและเครื่องใช้ไม้สอยต่างๆ” นายติดอยู่เดรนาธัตนานันกล่า

ร่วมกับผู้เขียน Xi Chen คนแรกจากสถาบัน Wellcome Sanger Institute เขาเป็นหัวหน้าในการพัฒนากรรมวิธีใหม่ๆรวมทั้งสร้างรายละเอียดเกี่ยวกับเซลล์ต่างๆเช่นเซลล์ภูมิคุ้มกันเซลล์ต้นกำเนิดฯลฯผู้ร่วมศึกษาค้นคว้าจากสถาบัน Wellcome Sanger ดังเช่น Ricardo J Miragaia รวมทั้งงานนี้ได้รับการดำเนินงานในห้องทดลองของคนเขียน Sarah A Teichmann ที่เกี่ยวข้อง

บทสรุปย่อของกระดาษให้คำชี้แจงนี้:

การตรวจหาลำดับเบสของ transposase-chromatography (ATAC-seq) ใช้กันอย่างล้นหลามเพื่อกำหนดขอบเขตของข้อบังคับทั่วอีกทั้งจีโนม อย่างไรก็ตามการเรียนจำนวนน้อยได้รับการปฏิบัติงานในระดับเซลล์คนเดียว(scATAC-seq) เพราะว่าความท้าทายทางเทคนิค ตรงนี้เราได้พัฒนากรรมวิธี scATACseq ที่เรียบง่ายรวมทั้งมีประสิทธิภาพโดยใช้การรวมแท็ก Tn5 ที่มีการจัดsingle-nuclei เราทำให้เห็นว่าขั้นตอนการของเราสามารถดำเนินการได้อย่างราบรื่นในระบบต่างๆรวมทั้งเซลล์ที่สดและก็เก็บรักษาได้จากเยื่อหลัก โดยการทำโปรไฟล์มากกว่า 3,000 splenocytes พวกเราจะระบุชนิดของเซลล์ภูมิคุ้มกันที่แตกต่างกันออกไปรวมทั้งแสดงขอบเขตการควบคุมดูแลเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับเซลล์แล้วก็ต้นเหตุการถอดรหัสที่เกี่ยวข้อง